Inconnu du grand public, Sébastien Lifshitz a réalisé au total six longs métrages. Le premier, Les Corps Ouverts, sort sur les écrans en 1998 et raconte la vie tourmentée et débauchée d'un adolescent de 18 ans en quête de repères. Le réalisateur belge poursuit l'année suivante en réalisant Les Terres Froides, puis Presque Rien en 2000.

2001, Sébastien Lifshitz passe au documentaire avec La Traversée, une oeuvre qui le met en scène à la recherche d'un son père. Après trois ans d'absence, le réalisateur revient ensuite avec Wild Side et Plein Sud, en 2009.

Il reçoit le César du Meilleur Documentaire à la 38e Cérémonie Des César 2013 pour son film Les Invisibles.

1998 : Les Corps Ouverts
1999 : Les Terres Froides
2000 : Presque Rien
2001 : La Traversée
2004 : Wild Side
2009 : Plein Sud
2012 : Les Invisibles
2013 : Bambi
2016 : Les Vies De Thérèse