Après des études de cinéma à l'université Sorbonne Nouvelle Paris 3 et un passage aux Beaux Arts d'Angoulême pour étudier la bande dessinée, il réalise son premier documentaire avec Dorine Brun, La Cause et l'Usage. Le film obtient le Prix des Bibliothèques et la mention du Jury Jeune au festival Cinéma du Réel en 2012. Puis il sort au cinéma le 5 septembre de la même année. Durant cette même édition du festival, Julien présente également son deuxième film, co-réalisé avec Guillaume Massart, Découverte d'un Principe en Case 3.

Il continue à collaborer avec Guillaume Massart et signe avec lui le film Le Centre en 2015. En 2018, c'est de nouveau avec Dorine Brun qu'il réalise Projections, présenté au Cinéma du Réel en 2018.Son dernier film, En Formation, est co-réalisé avec Sebastien Magnier.

Julien Meunier est aussi membre du comité éditorial et rédacteur de la revue de critique et de théorie de la bande dessinée Pré Carré.

• La Cause et l'Usage, en collaboration avec Dorine Brun, 2012 (LM)
• Découverte d'un Principe en Case 3, en collaboration avec Guillaume Massart, 2012 (CM)
• Le Centre, en collaboration avec Guillaume Massart, 2015 (CM)
• Projections, en collaboration avec Dorine Brun, 2018 (CM)
• En Formation, en collaboration avec Sébastien Magnier, 2020 (LM)